双龙记是讲述两位武学奇材的宿命死斗。咏春拳传人之子梁壁生性不羁，其父不欲传子独门武学。再者，梁壁天生好抱不平，爱到处闯祸，与高明结下不解之仇。 而高明，一直替富商龙金胜办事。一天，他失散的妹子，惨遭龙金胜强奸。他盛怒之下，杀尽龙家。在躲避期间，习得铁线拳，在武功大成后。他夺取了龙金胜的黑梁帮生意，更为夺小馒头的芳心，强行挑战梁壁。就在高明施予致命一击时，梁壁之父梁赞舍命相救。令他死里逃生…… 从此，梁壁变得意志消沉……直至遇上其父亲之师黄华宝，在他处习得了父亲不传武学。究竟梁壁能否为父报仇……
大宋年间，第一火炮专家凌振，擅长使用火药及研制各种火炮，梁山好汉与奸臣高俅麾下展开一场大战，战场上梁山好汉所向披靡，高俅为扭转战局调动大将军呼延灼的大军前往梁山剿匪，双方一度进入胶着战。
明朝万历年间，贵妃童娘娘为了把自己的儿子推上太子之位与东厂公公曹花若合谋，大肆诛杀秉真直谏的御史，一时间在京城内外掀起腥风血雨，不少知道真相的御史清官遭遇杀身之祸。给贵妃同娘娘和东厂公公曹花若充当杀手的，正是曹花若三个义子之一的马行空。 马行空的父亲曾是朝廷高官。父亲马长云在一场官场风波中无端丧身之后，年幼的马行空被东厂公公曹花若收养，跟随曹花若习武读书，练就一身非凡功夫，成为曹花若的杀人工具。马行空拿着义父与贵妃同娘娘共同拟就的一份诛杀名单，屡屡出手屡屡得手。一个个清官御史的人头落地，马行空开始为自己的魔鬼行径后怕反思。琴师灵儿是马行空陷入孤独困苦时结识的一个纯真哑女。和灵儿在一起时的本真感觉，使得马行空萌生退隐之意。马行空刚刚萌生退隐之意，义父曹花若就以马行空拒绝执行杀人任务，而派义子仇虎和冷战对马行空实施暗害。仇虎和冷战的伎俩落空，马行空从此与曹花若彻底决裂。为保护灵儿的安全，马行空带着灵儿逃离京城，来到京城外的一家客栈，将灵儿托付给江湖朋友柳冰玉，同时藏匿起将贵妃童娘娘和曹花若拟就的杀人名单。马行空背叛师门，曹花若决定清理门户，命义子仇虎和冷战一路追杀。仇虎和冷战追至客栈，柳冰玉八面玲珑，成功保护了灵儿，将仇虎和冷战引向马行空栖身的荒野小屋。马行空在客栈外的荒野小屋为仇虎和冷战准备好了葬身之地。仇虎和冷战自知不是师兄马行空的对手，冷战发出毒镖，马行空躲闪不及身中毒镖。马行空处境危险时，黑夜中突然杀出一个蒙面大侠，挡住仇虎和冷战，使得马行空带伤逃生。马行空于悬崖处坠崖而“死”，仇虎和冷战回京城向义父曹花若复命。马行空命不该绝，顺悬崖下的溪流漂流而下，得少林寺慧善大师妙手回生。马行空大难不死，给少林寺带来腾腾杀机。东厂公公曹花若亲自出马，挟持客栈里的灵儿，向少林寺奔杀而来。少林寺外，马行空与曹花若不共戴天，刑部总捕头张无忌带圣旨助阵。曹花若死于马行空的长剑之下，马行空了却家仇国恨，从此投身佛门修行向善。
小小渔村司马庄来了一个神秘道士。适逢司马庄的祖传宝贝石碑失窃，神秘道士又不偏不斜地在石碑失窃的地方摔了一跤，结果还没等神秘道士从地上爬起来就被司马庄的渔民团团围住，铁平捕头闻讯赶来，当即就要拿神秘道士去衙门审问。自称一清道长的神秘道士给司马庄呼来一场大雨，顿时引起司马庄人的敬畏。 一清道长能呼风唤雨，司马族长率全庄人来向铁平捕头求情，铁平突然从一清道长的相貌联想起生辰纲劫犯之一的公孙胜。自生辰纲在山东被劫以来，朝廷震怒，捕快也只抓住了一个白胜，让中书令如坐针毡，顶着摘顶子革职的巨大压力。铁平捕头将一清道长当作生辰纲被劫疑犯报给中书令，同时将一清道长羁押在司马庄。 一清道长并不急于离开司马庄，而是想帮司马庄人找回失窃的神碑。一清道长让族长集合全庄十五岁以上村民，在司马宗祠施法捉贼。全庄人当着铁平捕头和司马族长的的面，在一清道长面前蘸清水、过薪火、拜祖先，很快让心中有鬼的司马姑娘现行。一清道长给铁平和司马姑娘留足面子，跟司马庄人说神碑过两天就能自己“飞”回来。 原来，中书令看中了司马庄的神碑，想将神碑当作寿礼礼送给太守。中书令将窃取神碑一事交给铁平捕头，铁平捕头蛊惑司马姑娘一起，将神碑偷走，并藏匿于湖心小岛。两天之后，神碑并没有自己“飞”回原地，一清道长只好向铁平挑明原委。在铁平的快刀之下，一清道长来回几十个回合而不拔剑，让铁平更加坚信“一清道长”就是公孙胜。 一清道长帮铁平捕头在司马庄人面前遮羞，铁平捕头帮公孙胜在中书令面前撒谎，原本水火不相容的公孙胜与朝廷捕头一时达成了一笔交易。公孙胜和铁平捕头之间的交易，不仅帮司马庄找回失窃的神碑，更让中书令的特使黄虞侯亲临司马庄时，为司马庄永保司马家族神碑贴上了一张“护身符”。
